Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRS1Q15050 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms