Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms