Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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