Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms