Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIDRQ14159 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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