Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms