Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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