Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTR4Q13639 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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