Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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CDH18Q13634 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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