Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CDK5R2Q13319 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CDK5R2Q13319 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CDK5R2Q13319 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CDK5R2Q13319 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5R2Q13319 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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