Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NME3Q13232 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NME3Q13232 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NME3Q13232 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NME3Q13232 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NME3Q13232 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NME3Q13232 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NME3Q13232 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NME3Q13232 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NME3Q13232 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NME3Q13232 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NME3Q13232 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NME3Q13232 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NME3Q13232 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NME3Q13232 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NME3Q13232 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NME3Q13232 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NME3Q13232 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NME3Q13232 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NME3Q13232 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NME3Q13232 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NME3Q13232 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NME3Q13232 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NME3Q13232 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NME3Q13232 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NME3Q13232 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NME3Q13232 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NME3Q13232 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NME3Q13232 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
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