Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
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