Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PTPN13Q12923 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PTPN13Q12923 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PTPN13Q12923 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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