Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms