Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A2Q12908 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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