Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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TP53BP1Q12888 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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TP53BP1Q12888 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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TP53BP1Q12888 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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TP53BP1Q12888 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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TP53BP1Q12888 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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TP53BP1Q12888 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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TP53BP1Q12888 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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TP53BP1Q12888 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
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