Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms