Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms