Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms