Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAMSAP2Q08AD1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAMSAP2Q08AD1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAMSAP2Q08AD1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAMSAP2Q08AD1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAMSAP2Q08AD1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CAMSAP2Q08AD1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAMSAP2Q08AD1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAMSAP2Q08AD1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAMSAP2Q08AD1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAMSAP2Q08AD1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAMSAP2Q08AD1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAMSAP2Q08AD1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAMSAP2Q08AD1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAMSAP2Q08AD1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAMSAP2Q08AD1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CAMSAP2Q08AD1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAMSAP2Q08AD1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAMSAP2Q08AD1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CAMSAP2Q08AD1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAMSAP2Q08AD1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CAMSAP2Q08AD1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAMSAP2Q08AD1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAMSAP2Q08AD1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAMSAP2Q08AD1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CAMSAP2Q08AD1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms