Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms