Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FMODQ06828 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FMODQ06828 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FMODQ06828 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FMODQ06828 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FMODQ06828 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FMODQ06828 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms