Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms