Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms