Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms