Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms