Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms