Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms