Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms