Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms