Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms