Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms