Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms