Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EMP1P54849 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EMP1P54849 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EMP1P54849 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EMP1P54849 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EMP1P54849 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EMP1P54849 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EMP1P54849 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EMP1P54849 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EMP1P54849 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EMP1P54849 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EMP1P54849 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EMP1P54849 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EMP1P54849 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EMP1P54849 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EMP1P54849 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EMP1P54849 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EMP1P54849 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EMP1P54849 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EMP1P54849 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EMP1P54849 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EMP1P54849 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EMP1P54849 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms