Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms