Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP12AP54707 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms