Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms