Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms