Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMPHP49418 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMPHP49418 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AMPHP49418 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AMPHP49418 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AMPHP49418 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AMPHP49418 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AMPHP49418 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMPHP49418 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMPHP49418 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMPHP49418 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMPHP49418 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMPHP49418 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMPHP49418 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMPHP49418 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
AMPHP49418 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMPHP49418 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
AMPHP49418 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMPHP49418 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
AMPHP49418 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMPHP49418 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMPHP49418 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMPHP49418 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMPHP49418 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMPHP49418 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMPHP49418 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMPHP49418 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMPHP49418 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMPHP49418 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMPHP49418 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMPHP49418 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMPHP49418 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMPHP49418 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMPHP49418 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMPHP49418 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMPHP49418 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMPHP49418 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMPHP49418 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMPHP49418 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMPHP49418 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AMPHP49418 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMPHP49418 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMPHP49418 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMPHP49418 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMPHP49418 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMPHP49418 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMPHP49418 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMPHP49418 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMPHP49418 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMPHP49418 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMPHP49418 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMPHP49418 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMPHP49418 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AMPHP49418 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMPHP49418 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMPHP49418 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMPHP49418 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMPHP49418 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMPHP49418 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMPHP49418 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMPHP49418 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMPHP49418 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMPHP49418 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMPHP49418 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMPHP49418 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMPHP49418 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMPHP49418 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMPHP49418 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMPHP49418 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMPHP49418 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMPHP49418 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AMPHP49418 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMPHP49418 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMPHP49418 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMPHP49418 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMPHP49418 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMPHP49418 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AMPHP49418 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMPHP49418 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMPHP49418 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AMPHP49418 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMPHP49418 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMPHP49418 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMPHP49418 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMPHP49418 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMPHP49418 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AMPHP49418 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMPHP49418 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMPHP49418 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMPHP49418 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMPHP49418 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMPHP49418 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMPHP49418 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMPHP49418 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMPHP49418 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMPHP49418 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMPHP49418 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMPHP49418 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMPHP49418 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMPHP49418 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms