Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTAP49354 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTAP49354 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTAP49354 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTAP49354 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTAP49354 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTAP49354 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTAP49354 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTAP49354 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTAP49354 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTAP49354 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTAP49354 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTAP49354 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTAP49354 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTAP49354 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTAP49354 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTAP49354 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTAP49354 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTAP49354 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTAP49354 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTAP49354 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTAP49354 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTAP49354 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTAP49354 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTAP49354 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTAP49354 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTAP49354 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTAP49354 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTAP49354 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTAP49354 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTAP49354 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTAP49354 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTAP49354 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTAP49354 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTAP49354 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTAP49354 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTAP49354 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTAP49354 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTAP49354 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms