Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK8P49336 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK8P49336 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK8P49336 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK8P49336 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK8P49336 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK8P49336 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK8P49336 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK8P49336 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms