Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIA4P48058 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA4P48058 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms