Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms