Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGER3P43115 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms