Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A2P43004 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms