Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHI3L1P36222 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms