Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms