Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD34P28906 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CD34P28906 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CD34P28906 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CD34P28906 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CD34P28906 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD34P28906 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD34P28906 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms