Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
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