Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms