Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PLNP26678 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PLNP26678 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms